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Présentation de l’Ecole Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris
L’ESPCI Paris – PSL (École Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris) est une école d’ingénieurs généraliste qui forme, depuis 1882, des ingénieurs de rupture, adaptables et créatifs, dotés d’un solide bagage théorique et expérimental, conscients des enjeux de la société.
Elle est intégrée à un centre de recherche reconnu internationalement en physique, chimie et biologie (500 publications par an). Elle est connue pour sa capacité à transformer les connaissances issues de la recherche fondamentale en innovations de rupture (2 brevets par mois, 3 start-ups par an).
Distinguée par 6 Prix Nobel, elle accueille 400 élèves-ingénieurs, 530 chercheurs (dont 250 doctorants et 100 post-doctorants) dans 10 unités mixtes de recherche et environ 100 agents des fonctions support de la recherche et de l’enseignement.
Depuis sa création, l’ESPCI n’a cessé de mobiliser ses forces et compétences au service de sujets sociétaux majeurs et de défendre l’importance de la science au service de la société. L’environnement, la solidarité, la santé, l’accès et l’ouverture au savoir sont des enjeux que l’ESPCI s’est engagée à prendre en compte dans son quotidien tout en contribuant à les faire avancer. L’ESPCI défend l’égalité des chances et promeut la diversité sociale. Elle encourage et valorise l’engagement, notamment associatif, de ses étudiants.
Notre établissement fait partie de l’Université Paris Sciences & Lettres. Numéro 1 du classement mondial des jeunes universités publié par le Times Higher Education, PSL figure aussi dans le top 50 des meilleures universités mondiales (Shanghai, Times Higher Education, QS, CWUR).
L’ESPCI est engagée dans un vaste projet de rénovation de son campus parisien qui fera d’elle un des sites scientifiques les plus modernes de Paris.
Rattachement du poste
Le projet sera encadré par Audrey Combes, avec notamment la mise en place d’une réunion hebdomadaire de suivi de projet. Le suivi des formations professionnelles sera réalisé selon les procédures en vigueur à l’ED 388.
Sujet de thèse
Les larmes, sous-utilisées jusqu’ici, offrent un potentiel intéressant en tant que matrice biologique alternative (prélèvement peu invasif par rapport au liquide céphalo-rachidien) pour l’identification de biomarqueurs de pathologie(s) systémique(s). Ce projet doctoral vise donc (i) grâce à une approche métabolomique non ciblée, à standardiser le mode de collecte des larmes ainsi que le traitement de l’échantillon. En effet, les études menées jusqu’alors (principalement approches lipidomiques ciblées) démontrent que les systèmes de collecte (bandelettes ou capillaires) ainsi que les matériaux (verre ou PTFE) utilisés, combinés à une non-adaptation de la procédure de traitement de l’échantillon en amont de l’analyse par LC/HRMS conduisent à un potentiel biais d’échantillonnage ; puis (ii) grâce à une collaboration, déjà en cours sur un sujet connexe, à mettre en évidence de potentiels biomarqueurs lacrymaux de la maladie d’Alzheimer.
Missions et responsabilités
Les méthodes d’analyses couplant une séparation en RPLC (composants lipidiques) et en HILIC (petites molécules polaires) avec une détection par HRMS seront tout d’abord optimisées grâce à un échantillon commercial de pool de larmes humaines. Pour ce faire la soixantaine de petites molécules polaires (acides aminés, nucléotides, nucléosides, acides…), ainsi que des lipides appartenant aux différentes classes décrites dans la littérature comme étant présent dans les larmes (phospholipides, sphingolipides, acyl glycérol, stérols, lipides neutres et esters de cholestérol) seront quantifiés. Puis, une étude sera menée sur des larmes de différents types d’une personne saine afin d’étudier, grâce à la comparaison des profils LC/HRMS, les variations du métabolome lacrymal liées au type de larmes récoltées, basales ou induites (les larmes émotionnelles sont exclues de cette étude). Puis, différents dispositifs d’échantillonnage des larmes (bandelettes absorbantes ou capillaire), ainsi que différents matériaux les constituant (verre, PTFE ou autres polymères) seront comparés et éventuellement modifiés afin de conduire à un dispositif de prélèvement induisant le moins de biais lors de l’étape d’échantillonnage. Les méthodes de traitement de l’échantillon seront ensuite explorées afin d’optimiser le taux de récupération de l’ensemble des molécules indépendamment de leur propriétés physico-chimiques : (i) nature et volume de solvants utilisé et étape(s) de centrifugation pour extraire de façon efficace l’ensemble des molécules des bandelettes absorbantes ; (i) nécessité éventuelle d’une étape de rinçage du capillaire avec des solvants de différentes natures pour les échantillons prélevées par capillarité ; (iii) purification par extraction liquide/liquide des extraits obtenus ou étape(s) de concentration ou dilution. Ainsi l’ensemble des étapes de prélèvement et de traitement de l’échantillon préalable aux analyses du métabolome lacrymal par LC/HRMS aura été optimisé pour permettre d’avoir une vision la plus exhaustive (à la fois des petites molécules très polaires, comme certains acides aminés, et très apolaires, comme certains lipides) et fidèle (en termes de concentrations respectives des différentes molécules existantes) de la composition des larmes.
Dans un second temps, grâce à une collaboration déjà existante dans le cadre d’un projet connexe de collaboration scientifique entre la France et le Brésil et portant sur une approche métabolomique ciblée, les larmes de patients atteints de la MA à différents stades seront prélevées, par nos collaborateurs, avec la méthode optimisée. Les profils métaboliques lacrymaux LC/HRMS des patients atteints de la MA seront ensuite comparés à ceux de personnes saines afin de mettre en évidence de potentiels biomarqueurs lacrymaux de la MA.
Formation requise (ou diplôme) : Diplôme de Master 2 ou équivalent
Expérience souhaitée : Le candidat devra posséder des bases solides en chimie analytique (traitement de l’échantillon, analyses par LC-HRMS) et connaitre les traitements chimiométriques de grands jeux de données permettant la mise en évidence de biomarqueurs.
Modalités de Recrutement
Catégorie : A
Filière : Science
Corps : Ingénieur d’étude
Le poste est à pourvoir :
• par voie de mutation pour les agents titulaires de la Ville de Paris ;
• par voie de détachement pour les agents titulaires d’autres fonctions publiques ;
• par voie contractuelle pour une durée d’un an pour les agents non titulaires.
Les candidatures de personnes disposant de la RQTH sont encouragées.
Poste à pourvoir à compter du : 01/10/2024
Contact
Les candidatures (CV, lettre de motivation) sont à transmettre par courriel à audrey Combes en indiquant leur statut (Titulaire ou Non titulaire) ainsi que leur corps et grade (uniquement pour les titulaires)
Pour tout complément d’informations, contacter : audrey.combes@espci.fr
Lieu
10, Rue Vauquelin 75005 Paris
Métro ligne 7 (Place Monge/Censier Daubenton) - RER B (Luxembourg) - Bus 21, 27 & 47 - 3 Vélib’ stations à proximité.