Post-doctorat- Vers l’imagerie dynamique de l’activité cellulaire dans la rétine humaine in vivo (H/F)

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Présentation de l’École Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris

L’École Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris) est la première école d’ingénieurs française au classement de Shanghai.

Distinguée par 6 prix Nobel, elle allie recherche d’excellence (1 publication par jour), innovation (1 brevet par semaine, 3 start-up par an) et formation interdisciplinaire par la recherche.

Elle accueille 400 élèves ingénieurs, 600 chercheurs dans 9 unités mixtes de recherche et environ 100 agents de support de la recherche et de l’enseignement.

Rattachement du poste
Post-doctorat à l’Institut Langevin sous la responsabilité d’Olivier Thouvenin et Pedro Mêcé

Missions et responsabilités
La rétine fait l’objet d’intenses recherches à l’heure actuelle car elle permet d’avoir un accès direct optique au cerveau. La rétine fait effectivement partie du système nerveux central et de nombreuses maladies rétiniennes mais surtout neurodégénératives trouvent des manifestations dans l’altération de la rétine. Il y a donc un espoir de plus en plus crédible que l’imagerie haute résolution de la rétine permette de diagnostiquer de façon précoce ces maladies du système nerveux central, afin de mieux les traiter, de suivre leur progression, et de mieux évaluer les traitements mis en place. Un challenge actuel de l’imagerie de la rétine est la capacité de détecter toutes les cellules individuelles dans la rétine et de suivre leur état physiologique en temps réel. Si l’imagerie OCT commerciale est aujourd’hui capable de suivre la structure en 3D de la rétine, il manque la résolution et la sensibilité nécessaire à l’imagerie de cellules individuelles.

Au laboratoire, nous faisons partie des quelques équipes dans le monde à la pointe de l’imagerie cellulaire de la rétine, grâce au développement depuis de nombreuse années de l’OCT plein champ statique et dynamique. Pedro Mecê est spécialiste de l’imagerie in vivo de la rétine en OCT, et a mis en place deux montages d’OCT plein champ couplés à l’optique adaptative pour l’imagerie de la rétine in vivo haute résolution. L’imagerie fonctionelle des cellules rétiniennes est au cœur de son projet de recherche. Olivier Thouvenin est spécialiste de l’imagerie de tissus biologiques plutôt ex vivo, mais sur une modalité dite dynamique qui quantifie par OCT plein champ les mouvements actifs des structures internes aux cellules pour estimer l’état physiologique des cellules. Cette modalité dynamique permet notamment de suivre la dégénerescence d’explants rétiniens ou de rétines artificielles (organoïdes), et l’objectif de ce projet est de développer de nouvelles méthodes pour rendre ces mesures possibles in vivo.

Lors de nos travaux respectifs, nous avons pu quantifier les difficultés et les obstacles à surmonter avant de pouvoir réaliser une telle imagerie in vivo et ce projet vise à explorer une nouvelle configuration d’OCT, utilisant une illumination ligne et une détection dans le domaine spectral qui devrait permettre des performances optimales comme estimé récemment par des simulations théoriques. Les objectifs de ce projet sont :
• De développer un système d’OCT ligne spectral dédié à la microscopie dans un premier temps afin de valider la nouvelle technologie sur des explants de rétine.
• Augmenter la profondeur d’imagerie grâce au système ligne, des algorithmes de refocalisation, et des méthodes optiques telles que des faisceaux de Bessel.
• De démontrer qu’il est possible d’améliorer la résolution optique en OCT ligne en jouant sur la cohérence spatiale de l’illumination
• De venir simuler les mouvements axiaux de la rétine trouver la meilleure stratégie pour les compenser.
• De développer un second système optimisé pour l’imagerie de la rétine in vivo à partir des résultats obtenus sur le premier système.
Mis ensembles, ces travaux devraient permettent de déterminer les conditions de faisabilité de l’imagerie de la rétine dynamique in vivo et d’explorer une alternative technologique pour y parvenir plus efficacement.
Profil
Connaissances et qualités recherchées :
• Connaissances de biophysique et d’optique générale. Une connaissance théorique et pratique du fonctionnement des techniques de microscopie interférométrique, dont la tomographie à cohérence optique, est souhaitée.
• Maitrise de l’anglais et des compétences scientifiques de base (formulation d’une question, lecture d’articles, analyse des résultats, etc…)
• Une expérience de la manipulation d’objets biologiques, particulièrement des sphéroïdes ou organoïdes, est souhaitée.
• Maitrise d’outils informatiques, tels que Python ou Matlab

Formation requise (ou diplôme) : Doctorat
Les candidatures de personnes disposant de la RQTH sont encouragées. Ces personnes peuvent bénéficier d’un dispositif de recrutement dérogatoire de la Ville de Paris pour l’accès à l’emploi de titulaire.
Poste à pourvoir à compter du : 01/11/2024

Contact
Les candidatures (CV, lettre de motivation) sont à transmettre par courriel à olivier.thouvenin@espci.fr.
Pour tout complément d’informations, contacter : olivier.thouvenin@espci.fr

Lieu
Institut Langevin :
1 rue Jussieu, 75005, Paris
Métro ligne 7, ligne 10 (Jussieu) - 3 Vélib’ stations à proximité.

ESPCI
10, Rue Vauquelin 75005 Paris
Métro ligne 7 (Place Monge/Censier Daubenton) - RER B (Luxembourg) - Bus 21, 27 & 47 - 3 Vélib’ stations à proximité.





ÉCOLE SUPÉRIEURE DE PHYSIQUE ET DE CHIMIE INDUSTRIELLES DE LA VILLE DE PARIS
10 Rue Vauquelin, 75005 Paris